PLMD::PlumedMain Member List

This is the complete list of members for PLMD::PlumedMain, including all inherited members.

actionSet	PLMD::PlumedMain	private
actionSet_fwd	PLMD::PlumedMain	private
activateParseOnlyMode()	PLMD::PlumedMain
active	PLMD::PlumedMain	private
backwardPropagate()	PLMD::PlumedMain
bias	PLMD::PlumedMain	private
calc()	PLMD::PlumedMain
callErrorHandler(int code, const char *msg) const	PLMD::PlumedMain	inline
citations	PLMD::PlumedMain	private
citations_fwd	PLMD::PlumedMain	private
cite(const std::string &)	PLMD::PlumedMain
cltool	PLMD::PlumedMain	private
cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val=nullptr) override	PLMD::PlumedMain	virtual
cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val=nullptr)	PLMD::PlumedMain	inline
cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val=nullptr)	PLMD::PlumedMain	inline
cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, const std::size_t *shape)	PLMD::PlumedMain	inline
cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, std::initializer_list< SizeLike > shape)	PLMD::PlumedMain	inline
cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, I nelem, const std::size_t *shape=nullptr)	PLMD::PlumedMain	inline
cmd(const char *key, const TypesafePtr &val=nullptr)	PLMD::PlumedMain	inline
PLMD::WithCmd::cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val=nullptr)	PLMD::WithCmd	inlinevirtual
PLMD::WithCmd::cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, const std::size_t *shape)	PLMD::WithCmd	inline
PLMD::WithCmd::cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, std::initializer_list< SizeLike > shape)	PLMD::WithCmd	inline
PLMD::WithCmd::cmd(std::string_view key, const TypesafePtr &val, I nelem, const std::size_t *shape=nullptr)	PLMD::WithCmd	inline
PLMD::WithCmd::cmd(const char *key, const TypesafePtr &val=nullptr)	PLMD::WithCmd	inline
comm	PLMD::PlumedMain
comm_fwd	PLMD::PlumedMain	private
datoms	PLMD::PlumedMain	private
datoms_fwd	PLMD::PlumedMain	private
decreaseReferenceCounter() noexcept	PLMD::PlumedMain
detailedTimers	PLMD::PlumedMain
dlloader	PLMD::PlumedMain	private
dlloader_fwd	PLMD::PlumedMain	private
doCheckPoint	PLMD::PlumedMain	private
doParseOnly	PLMD::PlumedMain	private
enableNestedExceptions()	PLMD::PlumedMain
endPlumed	PLMD::PlumedMain	private
eraseFile(FileBase &)	PLMD::PlumedMain
error_handler	PLMD::PlumedMain	private
exchangePatterns	PLMD::PlumedMain	private
exchangePatterns_fwd	PLMD::PlumedMain	private
exchangeStep	PLMD::PlumedMain	private
exit(int c=0)	PLMD::PlumedMain
fclose(FILE *fp)	PLMD::PlumedMain
fflush()	PLMD::PlumedMain
files	PLMD::PlumedMain	private
fopen(const char *path, const char *mode)	PLMD::PlumedMain
getActionSet() const	PLMD::PlumedMain	inline
getAtoms()	PLMD::PlumedMain
getBias() const	PLMD::PlumedMain
getCPT() const	PLMD::PlumedMain	inline
getEndPlumed() const	PLMD::PlumedMain	inline
getExchangePatterns()	PLMD::PlumedMain	inline
getExchangeStep() const	PLMD::PlumedMain	inline
getGoodNumThreads(const T *x, unsigned s) const	PLMD::PlumedMain
getGoodNumThreads(const std::vector< T > &v) const	PLMD::PlumedMain
getGpuDeviceId() const	PLMD::PlumedMain	inline
getLog()	PLMD::PlumedMain
getNestedExceptions() const	PLMD::PlumedMain	inline
getNumThreads() const	PLMD::PlumedMain
getRealPrecision() const	PLMD::PlumedMain
getRestart() const	PLMD::PlumedMain	inline
getStep() const	PLMD::PlumedMain	inline
getSuffix() const	PLMD::PlumedMain	inline
getUnits()	PLMD::PlumedMain
getWork() const	PLMD::PlumedMain
gpuDeviceId	PLMD::PlumedMain
grex	PLMD::PlumedMain	private
increaseReferenceCounter() noexcept	PLMD::PlumedMain
init()	PLMD::PlumedMain
initialized	PLMD::PlumedMain	private
inputs	PLMD::PlumedMain	private
inputsAreActive() const	PLMD::PlumedMain
insertFile(FileBase &)	PLMD::PlumedMain
justApply()	PLMD::PlumedMain
justCalculate()	PLMD::PlumedMain
load(const std::string &)	PLMD::PlumedMain
log	PLMD::PlumedMain	private
log_fwd	PLMD::PlumedMain	private
MDEngine	PLMD::PlumedMain	private
MDQuantityToPLUMED(const std::string &unit, const TypesafePtr &m) const	PLMD::PlumedMain
multi_sim_comm	PLMD::PlumedMain
multi_sim_comm_fwd	PLMD::PlumedMain	private
name_of_energy	PLMD::PlumedMain	private
nestedExceptions	PLMD::PlumedMain	private
novirial	PLMD::PlumedMain
parseOnlyMode() const	PLMD::PlumedMain
passMap	PLMD::PlumedMain
passtools	PLMD::PlumedMain	private
performCalc()	PLMD::PlumedMain
performCalcNoForces()	PLMD::PlumedMain
performCalcNoUpdate()	PLMD::PlumedMain
pilots	PLMD::PlumedMain	private
plumedDat	PLMD::PlumedMain	private
PlumedMain()	PLMD::PlumedMain
plumedQuantityToMD(const std::string &unit, const double &eng, const TypesafePtr &m) const	PLMD::PlumedMain
prepareCalc()	PLMD::PlumedMain
prepareDependencies()	PLMD::PlumedMain
readBinary(std::istream &)	PLMD::PlumedMain
readInputFile(const std::string &str)	PLMD::PlumedMain
readInputFile(IFile &ifile)	PLMD::PlumedMain
readInputLine(const std::string &str, const bool &before_init=false)	PLMD::PlumedMain
readInputLines(const std::string &str)	PLMD::PlumedMain
readInputWords(const std::vector< std::string > &str, const bool &before_init)	PLMD::PlumedMain
referenceCounter	PLMD::PlumedMain	private
resetActive(bool active)	PLMD::PlumedMain	inline
resetInputs()	PLMD::PlumedMain
restart	PLMD::PlumedMain	private
runJobsAtEndOfCalculation()	PLMD::PlumedMain
setEndPlumed()	PLMD::PlumedMain	inline
setEnergyValue(const std::string &name)	PLMD::PlumedMain
setExchangeStep(bool f)	PLMD::PlumedMain	inline
setInputForce(const std::string &name, const TypesafePtr &val)	PLMD::PlumedMain
setInputValue(const std::string &name, const unsigned &start, const unsigned &stride, const TypesafePtr &val)	PLMD::PlumedMain
setRestart(bool f)	PLMD::PlumedMain	inline
setSuffix(const std::string &)	PLMD::PlumedMain	inline
setUnits(const bool &natural, const Units &u)	PLMD::PlumedMain
setupInterfaceActions()	PLMD::PlumedMain	private
shareAll()	PLMD::PlumedMain
shareData()	PLMD::PlumedMain
startStep()	PLMD::PlumedMain	private
step	PLMD::PlumedMain	private
stop()	PLMD::PlumedMain
stopFlag	PLMD::PlumedMain
stopFlag_fwd	PLMD::PlumedMain	private
stopNow	PLMD::PlumedMain
stopwatch	PLMD::PlumedMain	private
stopwatch_fwd	PLMD::PlumedMain	private
suffix	PLMD::PlumedMain	private
update()	PLMD::PlumedMain
updateFlags	PLMD::PlumedMain
updateFlagsPop()	PLMD::PlumedMain	inline
updateFlagsPush(bool)	PLMD::PlumedMain	inline
updateFlagsTop()	PLMD::PlumedMain	inline
useCountReferenceCounter() const noexcept	PLMD::PlumedMain
usingNaturalUnits() const	PLMD::PlumedMain
valueExists(const std::string &name) const	PLMD::PlumedMain
waitData()	PLMD::PlumedMain
work	PLMD::PlumedMain	private
writeBinary(std::ostream &) const	PLMD::PlumedMain
~PlumedMain()	PLMD::PlumedMain
~WithCmd()	PLMD::WithCmd	inlinevirtual