Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- m -

• MahalanobisDistance() : PLMD::refdist::MahalanobisDistance
• main() : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::cltools::CLToolSumHills, PLMD::cltools::Completion, PLMD::cltools::Driver< real >, PLMD::cltools::GenExample, PLMD::cltools::GenJson, PLMD::cltools::GenTemplate, PLMD::cltools::Info, PLMD::cltools::kt, PLMD::cltools::Manual, PLMD::cltools::PdbRenumber, PLMD::cltools::PesMD, PLMD::cltools::ShowGraph, PLMD::cltools::SimpleMD, PLMD::cltools::SwitchingPlotter, PLMD::mapping::PathTools, PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
• make_unique() : PLMD::Tools
• makeWhole() : PLMD::ActionAtomistic
• Manual() : PLMD::cltools::Manual
• Marginal() : PLMD::gridtools::Marginal
• MarginalWeight() : PLMD::ves::MarginalWeight
• MassChargeInput() : PLMD::generic::MassChargeInput
• mating() : PLMD::maze::Memetic
• Matrix() : PLMD::Matrix< T >
• matrix() : PLMD::metatomic::vesin::BoundingBox
• MatrixElementOutput() : PLMD::MatrixElementOutput
• MatrixForceIndexInput() : PLMD::matrixtools::MatrixForceIndexInput
• MatrixOperationBase() : PLMD::matrixtools::MatrixOperationBase
• MatrixProductDiagonal() : PLMD::refdist::MatrixProductDiagonal
• MatrixTimesMatrix() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesMatrix< T >
• MatrixTimesVector() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector
• MatrixTimesVectorBase() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorBase< T >
• MatrixTimesVectorInput() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorInput
• MatrixTimesVectorOutput() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorOutput
• Max() : PLMD::Communicator, PLMD::lepton::Operation::Max
• max_size() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• MaxEnt() : PLMD::bias::MaxEnt
• maybe_assign() : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false >, PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true >
• MD2double() : PLMD::DataPassingObject, PLMD::DataPassingObjectTyped< T >, PLMD::DataPassingTools, PLMD::DataPassingToolsTyped< T >
• MD_LinearExpansionPES() : PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
• MDQuantityToPLUMED() : PLMD::PlumedMain
• mean() : PLMD::maze::tls
• Member() : PLMD::maze::Member
• Memetic() : PLMD::maze::Memetic
• memFusionP() : PLMD::membranefusion::memFusionP
• mergeKernels() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• MetaD() : PLMD::bias::MetaD
• Metainference() : PLMD::isdb::Metainference
• MetainferenceBase() : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MetatomicPlumedAction() : PLMD::metatomic::MetatomicPlumedAction
• MFilterLess() : PLMD::multicolvar::MFilterLess
• MFilterMore() : PLMD::multicolvar::MFilterMore
• Min() : PLMD::Communicator, PLMD::lepton::Operation::Min
• minimise() : PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• Minimise1DBrent() : PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• MinimiseBase() : PLMD::MinimiseBase< FCLASS >
• modifyForceOnEnergy() : PLMD::ActionAtomistic
• modulo() : PLMD::VectorTyped< T, n >, PLMD::View< T, N >
• modulo2() : PLMD::VectorTyped< T, n >, PLMD::View< T, N >
• molfile_lock() : PLMD::Tools
• move_allocation_pointer() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign_default() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign_unequal_no_propagate() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_initialize() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_left() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_right() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• moveScaleOffset() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• moveSigmas() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• moveTilde() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MovingRestraint() : PLMD::bias::MovingRestraint
• mpiSumValuesAndDerivatives() : PLMD::Grid
• mt_eng() : PLMD::maze::rnd
• MultiColvarDensity() : PLMD::gridtools::MultiColvarDensity
• MultiColvarTemplate() : PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T >
• multiLinearInterpolation() : PLMD::ves::GridLinearInterpolation
• Multiply() : PLMD::lepton::Operation::Multiply
• MultiplyConstant() : PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant
• multiplyWithValues() : PLMD::ves::CoeffsVector
• MultiRMSD() : PLMD::colvar::MultiRMSD
• multiSimSumAverages() : PLMD::ves::VesBias
• mutation() : PLMD::maze::Memetic