PLMD::PlumedMain Member List

This is the complete list of members for PLMD::PlumedMain, including all inherited members.

actionSetPLMD::PlumedMainprivate
actionSet_fwdPLMD::PlumedMainprivate
activePLMD::PlumedMainprivate
atomsPLMD::PlumedMainprivate
atoms_fwdPLMD::PlumedMainprivate
backwardPropagate()PLMD::PlumedMain
biasPLMD::PlumedMainprivate
calc()PLMD::PlumedMain
callErrorHandler(int code, const char *msg) constPLMD::PlumedMaininline
citationsPLMD::PlumedMainprivate
citations_fwdPLMD::PlumedMainprivate
cite(const std::string &)PLMD::PlumedMain
cltoolPLMD::PlumedMainprivate
cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val=nullptr) overridePLMD::PlumedMainvirtual
cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val=nullptr)=0PLMD::PlumedMain
cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val, const std::size_t *shape)PLMD::PlumedMaininline
cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val, std::size_t nelem, const std::size_t *shape=nullptr)PLMD::PlumedMaininline
PLMD::WithCmd::cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val, const std::size_t *shape)PLMD::WithCmdinline
PLMD::WithCmd::cmd(const std::string &key, const TypesafePtr &val, std::size_t nelem, const std::size_t *shape=nullptr)PLMD::WithCmdinline
commPLMD::PlumedMain
comm_fwdPLMD::PlumedMainprivate
detailedTimersPLMD::PlumedMain
dlloaderPLMD::PlumedMainprivate
dlloader_fwdPLMD::PlumedMainprivate
doCheckPointPLMD::PlumedMainprivate
endPlumedPLMD::PlumedMainprivate
eraseFile(FileBase &)PLMD::PlumedMain
error_handlerPLMD::PlumedMainprivate
exchangePatternsPLMD::PlumedMainprivate
exchangePatterns_fwdPLMD::PlumedMainprivate
exchangeStepPLMD::PlumedMainprivate
exit(int c=0)PLMD::PlumedMain
fclose(FILE *fp)PLMD::PlumedMain
fflush()PLMD::PlumedMain
filesPLMD::PlumedMainprivate
fopen(const char *path, const char *mode)PLMD::PlumedMain
getActionSet() constPLMD::PlumedMaininline
getAtoms()PLMD::PlumedMaininline
getBias() constPLMD::PlumedMain
getCPT() constPLMD::PlumedMaininline
getExchangePatterns()PLMD::PlumedMaininline
getExchangeStep() constPLMD::PlumedMaininline
getGoodNumThreads(const T *x, unsigned s) constPLMD::PlumedMain
getGoodNumThreads(const std::vector< T > &v) constPLMD::PlumedMain
getLog()PLMD::PlumedMain
getNumThreads() constPLMD::PlumedMain
getRestart() constPLMD::PlumedMaininline
getStep() constPLMD::PlumedMaininline
getSuffix() constPLMD::PlumedMaininline
getWork() constPLMD::PlumedMain
grexPLMD::PlumedMainprivate
init()PLMD::PlumedMain
initializedPLMD::PlumedMainprivate
insertFile(FileBase &)PLMD::PlumedMain
justApply()PLMD::PlumedMain
justCalculate()PLMD::PlumedMain
load(const std::string &)PLMD::PlumedMain
logPLMD::PlumedMainprivate
log_fwdPLMD::PlumedMainprivate
MDEnginePLMD::PlumedMainprivate
multi_sim_commPLMD::PlumedMain
multi_sim_comm_fwdPLMD::PlumedMainprivate
mydatafetcherPLMD::PlumedMainprivate
novirialPLMD::PlumedMain
passMapPLMD::PlumedMain
performCalc()PLMD::PlumedMain
performCalcNoForces()PLMD::PlumedMain
performCalcNoUpdate()PLMD::PlumedMain
pilotsPLMD::PlumedMainprivate
plumedDatPLMD::PlumedMainprivate
PlumedMain()PLMD::PlumedMain
prepareCalc()PLMD::PlumedMain
prepareDependencies()PLMD::PlumedMain
readInputFile(const std::string &str)PLMD::PlumedMain
readInputFile(IFile &ifile)PLMD::PlumedMain
readInputLine(const std::string &str)PLMD::PlumedMain
readInputLines(const std::string &str)PLMD::PlumedMain
readInputWords(const std::vector< std::string > &str)PLMD::PlumedMain
resetActive(bool active)PLMD::PlumedMaininline
restartPLMD::PlumedMainprivate
runJobsAtEndOfCalculation()PLMD::PlumedMain
setEndPlumed()PLMD::PlumedMaininline
setExchangeStep(bool f)PLMD::PlumedMaininline
setRestart(bool f)PLMD::PlumedMaininline
setSuffix(const std::string &)PLMD::PlumedMaininline
shareData()PLMD::PlumedMain
stepPLMD::PlumedMainprivate
stop()PLMD::PlumedMain
stopFlagPLMD::PlumedMain
stopFlag_fwdPLMD::PlumedMainprivate
stopNowPLMD::PlumedMain
stopwatchPLMD::PlumedMainprivate
stopwatch_fwdPLMD::PlumedMainprivate
suffixPLMD::PlumedMainprivate
update()PLMD::PlumedMain
updateFlagsPLMD::PlumedMain
updateFlagsPop()PLMD::PlumedMaininline
updateFlagsPush(bool)PLMD::PlumedMaininline
updateFlagsTop()PLMD::PlumedMaininline
waitData()PLMD::PlumedMain
workPLMD::PlumedMainprivate
~PlumedMain()PLMD::PlumedMain
~WithCmd()PLMD::WithCmdinlinevirtual