Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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• i0e() : PLMD::isdb::SAXS
• identity() : PLMD::TensorTyped< T, n, m >
• IFile() : PLMD::IFile
• ignoreMaskArguments() : PLMD::ActionWithVector
• ignoreStoredValue() : PLMD::Value
• imageToString() : PLMD::Register
• inbounds() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• Include() : PLMD::generic::Include
• increase_size() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• increase_value() : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix, PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
• IncreasedPrecis() : PLMD::Random
• increaseIterationCounter() : PLMD::ves::Optimizer
• increaseReferenceCounter() : PLMD::PlumedMain
• increasingOrder() : PLMD::function::FuncPathMSD
• increment_length() : PLMD::metatomic::vesin::cpu::GrowableNeighborList
• index() : PLMD::AtomNumber
• indexesPerScalar() : PLMD::ForceIndexHolder
• indicesExist() : PLMD::ves::CoeffsBase
• Info() : PLMD::cltools::Info
• Init() : PLMD::GridBase
• init() : PLMD::fileParser, PLMD::PlumedMain, PLMD::switchContainers::cosinusSwitch, PLMD::switchContainers::cubicSwitch, PLMD::switchContainers::Data, PLMD::switchContainers::exponentialSwitch, PLMD::switchContainers::fastgaussianSwitch, PLMD::switchContainers::gaussianSwitch, PLMD::switchContainers::nativeqSwitch, PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >, PLMD::switchContainers::smapSwitch, PLMD::switchContainers::tanhSwitch, PLMD::TrajectoryParser
• init_cs() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_fromObs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_linkECVs() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_pntrToECVsClass() : PLMD::opes::OPESexpanded
• init_rings() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• init_shape() : PLMD::TypesafePtr
• init_types() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• initECVs() : PLMD::opes::ECVcustom, PLMD::opes::ECVlinear, PLMD::opes::ECVmultiThermal, PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric, PLMD::opes::ECVumbrellasFile, PLMD::opes::ECVumbrellasLine
• initECVs_observ() : PLMD::opes::ECVcustom, PLMD::opes::ECVlinear, PLMD::opes::ECVmultiThermal, PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric, PLMD::opes::ECVumbrellasFile, PLMD::opes::ECVumbrellasLine, PLMD::opes::ExpansionCVs
• initECVs_restart() : PLMD::opes::ECVcustom, PLMD::opes::ECVlinear, PLMD::opes::ECVmultiThermal, PLMD::opes::ECVmultiThermalBaric, PLMD::opes::ECVumbrellasFile, PLMD::opes::ECVumbrellasLine, PLMD::opes::ExpansionCVs
• Initialise() : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• initialize() : PLMD::NeighborList
• initialize_members() : PLMD::maze::Memetic
• initializeCoeffs() : PLMD::ves::VesBias
• initialized() : PLMD::Communicator
• initializeIndices() : PLMD::ves::CoeffsBase
• inlinable() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_capacity() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inline_storage() : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity >
• inlined() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inPair() : PLMD::ERMSD
• InPlaneDistances() : PLMD::multicolvar::InPlaneDistances
• inputsAreActive() : PLMD::PlumedMain
• InputVectors() : PLMD::matrixtools::InputVectors
• insert() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• insert_copies() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insert_range_helper() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• insertFile() : PLMD::PlumedMain
• installed() : PLMD::DLLoader
• integrate() : PLMD::Grid
• IntegrateGrid() : PLMD::gridtools::IntegrateGrid
• integrateGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• internal_range_length() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >, PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• InterpolateGrid() : PLMD::gridtools::InterpolateGrid
• interpolation() : PLMD::isdb::SAXS
• Interpolator() : PLMD::gridtools::Interpolator
• interpretArgumentList() : PLMD::ActionWithArguments
• interpretAtomList() : PLMD::ActionAtomistic
• interpretDataLabel() : PLMD::ActionShortcut
• interpretLabel() : PLMD::Tools
• interpretRanges() : PLMD::Tools
• interpretSymbol() : PLMD::GenericMolInfo
• intervalBounded() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalDerivf() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMean() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intervalRange() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMax() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMaxStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMin() : PLMD::ves::BasisFunctions
• intrinsicIntervalMinStr() : PLMD::ves::BasisFunctions
• inverse() : PLMD::metatomic::vesin::Matrix, PLMD::TensorTyped< T, n, m >
• InvertMatrix() : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• is_chi1_cx() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• is_inlinable() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• is_local_search_on() : PLMD::maze::Memetic
• is_pbc_on() : PLMD::maze::Optimizer
• isActionNeeded() : PLMD::Keywords
• isActionSuffixed() : PLMD::Keywords
• isActive() : PLMD::Action, PLMD::ves::CoeffsBase
• isAnalysis() : PLMD::Keywords
• isArgument() : PLMD::Keywords::keyInfo
• isAtomList() : PLMD::Keywords::KeyType
• isBiasCutoffAllowed() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isBiasFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isBiasOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isCompulsory() : PLMD::Keywords::KeyType
• isConstant() : PLMD::lepton::ParsedExpression, PLMD::Value
• isDeprecated() : PLMD::Keywords::KeyType
• isDerivativeZeroWhenValueIsZero() : PLMD::Value
• isDiagonal() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isDLRegistering() : PLMD::Register
• isDriver() : PLMD::Keywords
• isDynamic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isDynamicTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• Isend() : PLMD::Communicator
• isFesFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFesProjFileOutputActive() : PLMD::ves::VesBias
• isFesProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isFlag() : PLMD::Keywords::KeyType
• isGenericCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isHidden() : PLMD::Keywords::KeyType
• isInfixOperator() : PLMD::lepton::Operation::Add, PLMD::lepton::Operation::Divide, PLMD::lepton::Operation, PLMD::lepton::Operation::Multiply, PLMD::lepton::Operation::Power, PLMD::lepton::Operation::PowerConstant, PLMD::lepton::Operation::Subtract
• isIterationCounterActive() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isMultiLinearBasisSetCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase
• isNotPeriodic() : PLMD::HistogramBead
• isOpen() : PLMD::FileBase
• isOptional() : PLMD::Keywords::KeyType
• isOptionOn() : PLMD::Action
• isOrthorombic() : PLMD::Pbc
• isPeriodic() : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject, PLMD::HistogramBead, PLMD::Value
• isPlumedGlobal() : PLMD::DLLoader
• isReduced() : PLMD::LatticeReduction
• isReduced2() : PLMD::LatticeReduction
• isRescaledToBias() : PLMD::BiasRepresentation
• isReweightFactorCalculated() : PLMD::ves::VesBias
• isSet() : PLMD::Pbc
• isSP2() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• isStatic() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isStaticTargetDistFileOutputActive() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::VesBias
• isSymmetric() : PLMD::lepton::Operation::Add, PLMD::lepton::Operation, PLMD::lepton::Operation::Multiply, PLMD::Matrix< T >, PLMD::Value, PLMD::ves::CoeffsMatrix
• isTargetDistGridShiftedToZero() : PLMD::ves::TargetDistribution
• isTargetDistOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTargetDistProjOutputActive() : PLMD::ves::Optimizer
• isTerminalGroup() : PLMD::MolDataClass
• isWhole() : PLMD::GenericMolInfo