Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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• wait() : PLMD::ActionForInterface, PLMD::ActionToPutData, PLMD::colvar::Energy, PLMD::Communicator::Request, PLMD::DomainDecomposition, PLMD::PbcAction
• waitData() : PLMD::PlumedMain
• Walls() : PLMD::bias::Walls
• warning() : PLMD::Action
• WellTemperedModifer() : PLMD::ves::WellTemperedModifer
• wereSet() : PLMD::CheckInRange
• Wham() : PLMD::wham::Wham
• WhamHistogram() : PLMD::wham::WhamHistogram
• WhamWeights() : PLMD::wham::WhamWeights
• what() : PLMD::Exception, PLMD::lepton::Exception
• WholeMolecules() : PLMD::generic::WholeMolecules
• wipe() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• WrapAround() : PLMD::generic::WrapAround
• write_1D_pmf() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• write_files() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• write_final_positions() : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_model_overlap() : PLMD::isdb::EMMI
• write_positions() : PLMD::cltools::SimpleMD
• write_statistics() : PLMD::cltools::SimpleMD
• writeBasisFunctionsToFile() : PLMD::ves::BasisFunctions
• writeBiasGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeBiasOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeBiasToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeBiasWithoutCutoffGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeBinary() : PLMD::ActionForInterface, PLMD::ActionToPutData, PLMD::DomainDecomposition, PLMD::PlumedMain, PLMD::Value
• writeCoeffsInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• writeCubeFile() : PLMD::GridBase
• writeDataDiagonalToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeDataFullToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeDataToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• writeFesGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeFesOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeFesProjGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeFesProjOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeFesProjToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeFesToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeGaussian() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• writehead() : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• writeHeader() : PLMD::GridBase
• writeHeaderToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• writeInGraph() : PLMD::Action, PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase< T >, PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >, PLMD::function::FunctionOfScalar< T >, PLMD::function::FunctionOfVector< T >, PLMD::function::FunctionWithSingleArgument< T >, PLMD::generic::Print, PLMD::generic::PrintNDX, PLMD::gridtools::FunctionOfGrid< T >, PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorBase< T >
• writeIterationCounterAndTimeToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• WriteLagrangians() : PLMD::bias::MaxEnt
• writeLogTargetDistGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeMatrixInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• writeOutObservable() : PLMD::fisst::FISST
• writeOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeOutRestart() : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
• WriteStateFull() : PLMD::Random
• writeStatus() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• writeTargetDistGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeTargetDistProjGridToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistProjOutputFiles() : PLMD::ves::Optimizer
• writeTargetDistProjToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeTargetDistributionToFile() : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• writeTargetDistToFile() : PLMD::ves::VesBias, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• writeTimeInfoToFile() : PLMD::ves::CoeffsBase
• writeToFile() : PLMD::Grid, PLMD::GridBase, PLMD::SparseGrid, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector