Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:

- i -

• i : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureDRMSDInput::pairDistance
• IA : PLMD::Random
• id : PLMD::ActionRegistration< ActionClass >
• ideal_buffer : PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
• ideal_total : PLMD::gch::default_buffer_size< Allocator >
• identical_coeffs_shape_ : PLMD::ves::Optimizer
• idum : PLMD::Random
• ifile : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::generic::Read
• ifile_ptr : PLMD::generic::Read
• ifiles : PLMD::function::FilesHandler
• ifiles_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• ifilesnames : PLMD::bias::MaxEnt
• ifilesnames_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• ifix1 : PLMD::mapping::PathReparameterization
• ifix2 : PLMD::mapping::PathReparameterization
• ignore_forces : PLMD::generic::Read
• ignore_time : PLMD::generic::Read
• ignoreFields : PLMD::IFile
• igolden : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• IM : PLMD::Random
• imag_modes : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• imgVec : PLMD::colvar::PathMSDBase
• in : PLMD::CLToolMain
• in_ : PLMD::sizeshape::position_linear_proj, PLMD::sizeshape::position_maha_dist
• in_progress : PLMD::Tools::CriticalSectionWithKey< Key >
• in_restart_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
• in_restart_name_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
• incoord_to_hbcoord : PLMD::pamm::HBPammMatrix
• incPrec : PLMD::Random
• index : PLMD::colvar::PathMSDBase::ImagePath, PLMD::generic::Plumed, PLMD::metatomic::vesin::cpu::CellList::Point
• index_ : PLMD::AtomNumber
• index_k_ : PLMD::opes::OPESexpanded
• indexCnt : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexDsp : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexes : PLMD::ActionAtomistic
• indexmap : PLMD::function::FuncPathMSD
• indexR : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexS : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• indexToBeReceived : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• indexToBeSent : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• indexvec : PLMD::colvar::PathMSDBase
• indices : PLMD::ForceIndexHolder, PLMD::matrixtools::MatrixForceIndexInput, PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorInput
• indices_shape_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• inept : PLMD::isdb::PRE
• info : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• init : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• init_stp : PLMD::piv::PIV::SharedData
• initial_weight_dist_ : PLMD::fisst::FISST
• initial_weight_rate_ : PLMD::fisst::FISST
• initialBias : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• initialized : PLMD::GREX, PLMD::PlumedMain
• initstride : PLMD::function::FuncSumHills
• inline_capacity_v : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• inMiddleOfField : PLMD::IFile
• innerCollection : PLMD::LinkCells
• input : PLMD::colvar::RMSDVector
• input_buffer : PLMD::colvar::RMSDVector, PLMD::ParallelTaskManager< T >
• input_count : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_filename : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_grad : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
• input_is_constant : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• input_of_each_layer : PLMD::function::annfunc::ANN
• inputData : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool
• inputdata : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::ParallelActionsInput
• inputf : PLMD::matrixtools::OutputProductFunc
• inputForce : PLMD::Value
• inputs : PLMD::DomainDecomposition, PLMD::PlumedMain
• insertion : PLMD::molfile::molfile_atom_t
• inst_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• integratehills : PLMD::function::FuncSumHills
• integratehisto : PLMD::function::FuncSumHills
• intensities : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• intercomm : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::generic::Plumed, PLMD::GREX
• intercomm_fwd : PLMD::GREX
• interface : PLMD::colvar::Energy, PLMD::PbcAction
• interpolation_type : PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction
• interval : PLMD::logmfd::LogMFD
• interval_bounded_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_intrinsic_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_max_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_max_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_mean_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_min_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_min_str_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• interval_range_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• inthessian : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• intracomm : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::GREX
• intracomm_fwd : PLMD::GREX
• intValue : PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
• inv_cov_md_ : PLMD::isdb::EMMI
• inv_gamma_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• inv_max_minus_min : PLMD::function::Combine::component, PLMD::function::Moments, PLMD::gridtools::RegularKernel< K >, PLMD::HistogramBead, PLMD::matrixtools::Dissimilarities, PLMD::refdist::Difference, PLMD::Value
• inv_normfactor_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines, PLMD::ves::BF_Powers
• inv_pi2_ : PLMD::isdb::BAIES
• inv_r_eff_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• inv_sigma_ : PLMD::ves::BF_Gaussians
• inv_spacing_ : PLMD::ves::BF_CubicBsplines
• inv_sqrt2_ : PLMD::isdb::BAIES, PLMD::isdb::EMMI
• invalidateList : PLMD::colvar::CoordinationBase, PLMD::s2cm::S2ContactModel
• invbeta : PLMD::BiasWeight, PLMD::ProbWeight, PLMD::ves::FesWeight
• invbiasf_ : PLMD::ves::WellTemperedModifer
• invBox : PLMD::Pbc
• inverse : PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• inverse_ : PLMD::metatomic::vesin::BoundingBox
• invr0 : PLMD::switchContainers::Data
• invr0_ : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• invr0_2 : PLMD::switchContainers::Data
• invReduced : PLMD::Pbc
• invsigma : PLMD::bias::MetaD::Gaussian, PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
• iov_base : PLMD::molfile::fio_iovec
• iov_len : PLMD::molfile::fio_iovec
• ipos : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
• iprecision : PLMD::generic::DumpAtoms
• IQ : PLMD::Random
• Iq0 : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix_D : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_mix_H : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_solv : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_solv_H : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac_D : PLMD::isdb::SAXS
• Iq0_vac_H : PLMD::isdb::SAXS
• IR : PLMD::Random
• ir_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
• is_active : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
• is_file : PLMD::TypesafePtr
• is_floating_point : PLMD::TypesafePtr
• is_integral : PLMD::TypesafePtr
• isaction : PLMD::Keywords
• isatoms : PLMD::Keywords
• isChargeSet_ : PLMD::vatom::Center
• iscltool : PLMD::function::FuncSumHills
• isDerivative : PLMD::lepton::Operation::Custom
• iselect : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• isFirstStep : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift, PLMD::isdb::SAXS, PLMD::ves::Optimizer
• isFirstStep_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD, PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::VesDeltaF
• isInitialized : PLMD::RMSDCoreData
• isIntPower : PLMD::lepton::Operation::PowerConstant
• isMassSet_ : PLMD::vatom::Center
• ismatrix : PLMD::function::FunctionWithSingleArgument< T >, PLMD::function::Sum, PLMD::ParallelTaskManager< T >
• isopen : PLMD::function::FilesHandler
• isperiodic : PLMD::function::Moments
• isproduct : PLMD::matrixtools::OuterProductBase< T >
• isReady_ : PLMD::opes::ExpansionCVs
• isreference_ : PLMD::isdb::Shadow
• iswhole_ : PLMD::GenericMolInfo
• items : PLMD::Citations
• iter_counter : PLMD::ves::Optimizer
• iteration_and_time_active_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• iteration_opt : PLMD::ves::CoeffsBase
• ITMAX : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• iv : PLMD::Random
• iy : PLMD::Random