Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:
- o -
- obs_cvs_ : PLMD::opes::OPESexpanded
- obs_steps_ : PLMD::opes::OPESexpanded
- observable_freq_ : PLMD::fisst::FISST
- observable_weight_ : PLMD::fisst::FISST
- occupancies : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- occupancy : PLMD::generic::DumpPDB, PLMD::molfile::molfile_atom_t, PLMD::PDB
- of : PLMD::generic::DumpAtoms, PLMD::generic::DumpDerivatives, PLMD::generic::DumpForces, PLMD::generic::DumpProjections
- offset : PLMD::bias::LWalls, PLMD::bias::UWalls
- offset_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- offset_c_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
- offset_max_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- offset_min_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- offset_mu_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- offset_prior_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- ofile : PLMD::generic::Committor, PLMD::generic::Debug, PLMD::generic::Print, PLMD::generic::PrintNDX
- old_KDEnorm_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
- oldaa : PLMD::bias::MovingRestraint
- olddpotdk : PLMD::bias::MovingRestraint
- oldf : PLMD::bias::MovingRestraint
- oldk : PLMD::bias::MovingRestraint
- oldlambda : PLMD::bias::MaxEnt
- omp_forces : PLMD::ParallelTaskManager< T >
- on : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms, PLMD::generic::UpdateIf
- one_minus_weight_decay_ : PLMD::ves::Opt_Adam
- onebead : PLMD::isdb::SAXS
- oneD_pmf : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- onefile : PLMD::generic::DumpVector, PLMD::gridtools::DumpGrid
- ONEOVERS2C2CUTOFF : PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP, PLMD::membranefusion::memFusionP
- open_file_read : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
- open_file_write : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
- operation : PLMD::lepton::CompiledExpression, PLMD::lepton::ExpressionTreeNode
- operations : PLMD::lepton::ExpressionProgram
- opt : plumed_safeptr, plumed_safeptr_x
- opt_ : PLMD::maze::Optimizer
- opt_pntrs_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- opt_value_ : PLMD::maze::Optimizer
- optimization_threshold_ : PLMD::ves::VesBias
- optimize_coeffs_ : PLMD::ves::VesBias
- optimized_step_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- optimizer_ : PLMD::maze::OptimizerBias
- optimizer_pntr_ : PLMD::ves::VesBias
- optimizer_stride_ : PLMD::maze::Optimizer
- options : PLMD::metatomic::vesin::cpu::GrowableNeighborList
- optsigmamean_stride_ : PLMD::isdb::Caliber, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
- orbital_energies : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- orbital_ids : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
- order : PLMD::function::Bessel
- origin : PLMD::LinkCells, PLMD::molfile::molfile_volumetric_t
- originalpath : PLMD::Tools::DirectoryChanger
- oss : PLMD::OFile
- out : PLMD::CLToolMain
- out_ : PLMD::sizeshape::position_linear_proj
- out_coupling_ : PLMD::eds::EDS
- out_observable_ : PLMD::fisst::FISST
- out_observable_name_ : PLMD::fisst::FISST
- out_restart_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
- out_restart_name_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
- outhills : PLMD::function::FuncSumHills
- outhisto : PLMD::function::FuncSumHills
- outmat : PLMD::adjmat::TorsionsMatrixInput, PLMD::matrixtools::MatrixTimesMatrixInput< T >, PLMD::matrixtools::OuterProductInput< T >, PLMD::RequiredMatrixElementsUpdater
- output : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
- output_filename : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- output_fmt_ : PLMD::ves::CoeffsBase
- output_freq : PLMD::drr::UIestimator::UIestimator
- output_grid : PLMD::gridtools::InterpolateGrid, PLMD::gridtools::Marginal
- output_of_each_layer : PLMD::function::annfunc::ANN
- output_type : PLMD::fourier::FourierTransform
- outputForces : PLMD::bias::Bias
- ovdd_ : PLMD::isdb::EMMI
- ovfilename_ : PLMD::isdb::EMMI
- ovmd_ : PLMD::isdb::EMMI
- ovmd_ave_ : PLMD::isdb::EMMI
- ovmd_der_ : PLMD::isdb::EMMI
- ovstride_ : PLMD::isdb::EMMI