Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- n -

• N : PLMD::isdb::SAXS
• n : PLMD::ActionToPutData, PLMD::colvar::GHBFIX
• N_ATOM : PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• n_global_iterations_ : PLMD::maze::Memetic
• n_i_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• n_interpolation_ : PLMD::fisst::FISST
• n_iter_ : PLMD::maze::Optimizer
• n_local_iterations_ : PLMD::maze::Memetic
• n_matrix() : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix
• N_optimized_step_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• n_samples_ : PLMD::fisst::FISST
• n_search_ : PLMD::metatomic::vesin::cpu::CellList
• n_tempering_options_ : PLMD::bias::MetaD
• n_threads_ : PLMD::maze::Optimizer
• n_vector() : PLMD::drr::UIestimator::n_vector< T >
• nactive : PLMD::contour::DistanceFromContourBase, PLMD::MultiValue
• nallpairs_ : PLMD::NeighborList
• name : PLMD::Action, PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs, PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::FileBase::FieldBase, PLMD::lepton::Operation::Custom, PLMD::lepton::Operation::Variable, PLMD::molfile::molfile_atom_t, PLMD::Random, PLMD::Value
• name_of_energy : PLMD::PlumedMain
• name_stem : PLMD::bias::MetaD::TemperingSpecs
• names : PLMD::BiasRepresentation, PLMD::generic::DumpAtoms
• NANDELTA : PLMD::lepton::Operation
• Nandelta() : PLMD::lepton::Operation::Nandelta
• nanneal_ : PLMD::isdb::EMMI
• narg : PLMD::function::Ensemble, PLMD::function::LocalEnsemble, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• nargs : PLMD::function::Sort, PLMD::LeptonCall
• nargs_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• nativeqSwitch() : PLMD::switchContainers::nativeqSwitch
• Natm : PLMD::piv::PIV
• natoms : PLMD::ERMSD, PLMD::molfile::md_header, PLMD::molfile::md_ts, PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO, PLMD::xdrfile::t_trnheader
• natoms_per_list : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• nbasins : PLMD::generic::Committor
• nbasis_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• nbasisf_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• nbiases_ : PLMD::ves::Optimizer
• nbin : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject, PLMD::gridtools::InterpolateGrid, PLMD::gridtools::KDE
• nbin_ : PLMD::GridBase
• NBINS : PLMD::funnel::Funnel
• nbins : PLMD::contour::FindSphericalContour, PLMD::gridtools::KDE
• nbins_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• NBINZ : PLMD::funnel::Funnel
• nbytes : PLMD::Communicator::ConstData, PLMD::Communicator::Data
• Nc : PLMD::isdb::CS2Backbone
• ncart : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• ncells : PLMD::LinkCells
• ncenters_ : PLMD::ves::TD_ExponentiallyModifiedGaussian, PLMD::ves::TD_Gaussian, PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal, PLMD::ves::TD_VonMises
• NCG : PLMD::isdb::JCoupling
• ncoeffs_ : PLMD::ves::CoeffsBase, PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::VesLinearExpansion
• ncoeffs_total_ : PLMD::ves::VesBias
• ncoeffssets_ : PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
• ncols() : PLMD::Matrix< T >, PLMD::Value
• ncolumns_ : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• ncoupl_ : PLMD::isdb::JCoupling
• ncv_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• ncvs_ : PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST
• ncycles : PLMD::dimred::ArrangePoints
• nderivatives : PLMD::adjmat::TorsionsMatrix, PLMD::crystdistrib::QuaternionBondProductMatrix, PLMD::crystdistrib::QuaternionProductMatrix, PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >, PLMD::function::FunctionOfVector< T >, PLMD::matrixtools::MatrixTimesMatrix, PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector, PLMD::matrixtools::OuterProduct, PLMD::MultiValue
• ndim : PLMD::BiasRepresentation, PLMD::KernelFunctions
• ndimensions_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• ndist_ : PLMD::ves::TD_LinearCombination, PLMD::ves::TD_ProductCombination, PLMD::ves::TD_ProductDistribution
• NDIV : PLMD::Random
• neededActions : PLMD::Keywords
• needs_bias_grid_ : PLMD::ves::TargetDistribution
• needs_bias_withoutcutoff_grid_ : PLMD::ves::TargetDistribution
• needs_fes_grid_ : PLMD::ves::TargetDistribution
• needsAction() : PLMD::Keywords
• NEGATE : PLMD::lepton::Operation
• Negate() : PLMD::lepton::Operation::Negate
• negativebias : PLMD::function::FuncSumHills
• neigh_size : PLMD::colvar::PathMSDBase, PLMD::function::FuncPathGeneral, PLMD::function::FuncPathMSD
• neigh_stride : PLMD::colvar::PathMSDBase, PLMD::function::FuncPathGeneral, PLMD::function::FuncPathMSD
• NEIGHBOR : PLMD::ExchangePatterns
• neighbor_list_ : PLMD::maze::Optimizer
• NeighborList() : PLMD::NeighborList
• Neighbors() : PLMD::adjmat::Neighbors
• neighbors : PLMD::gridtools::KDE, PLMD::metatomic::vesin::cpu::GrowableNeighborList
• neighbors_ : PLMD::NeighborList
• neighbour_list_updated : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• neighpair : PLMD::function::FuncPathGeneral, PLMD::function::FuncPathMSD
• nelem : PLMD::TypesafePtr, plumed_safeptr, plumed_safeptr_x
• nested : plumed_error
• nestedExceptions : PLMD::PlumedMain
• never_activate : PLMD::Action
• never_reduce_tasks : PLMD::ActionWithVector
• newbox : PLMD::generic::ResetCell
• nexp_ : PLMD::isdb::EMMI
• next_action_in_chain : PLMD::ActionWithMatrix
• next_cauchy() : PLMD::maze::rnd
• next_double() : PLMD::maze::rnd
• next_int() : PLMD::maze::rnd
• next_plmd_vector() : PLMD::maze::rnd
• next_std_vector() : PLMD::maze::rnd
• nfgrid : PLMD::dimred::ArrangePoints
• nframes : PLMD::colvar::PathMSDBase
• nga : PLMD::isdb::NOE, PLMD::isdb::PRE
• ngrid_der : PLMD::Value
• nh : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• nimag : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• nindices : PLMD::MultiValue
• nintcoords : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• Nj : PLMD::isdb::SAXS
• nl : PLMD::colvar::ContactMap, PLMD::colvar::CoordinationBase, PLMD::colvar::EEFSolv, PLMD::isdb::NOE, PLMD::isdb::PRE, PLMD::piv::PIV, PLMD::s2cm::S2ContactModel
• nl_ : PLMD::isdb::EMMI
• nl_buffer : PLMD::colvar::EEFSolv
• nl_cut : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• nl_cut2 : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• nl_cutoff_ : PLMD::isdb::EMMI, PLMD::maze::Optimizer
• nl_skin : PLMD::piv::PIV
• nl_stride : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase, PLMD::colvar::EEFSolv
• nl_stride_ : PLMD::isdb::EMMI, PLMD::maze::Optimizer
• nl_update : PLMD::colvar::EEFSolv, PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO
• nlall : PLMD::piv::PIV
• nlandmarks : PLMD::landmarks::FarthestPointSampling
• nlcom : PLMD::piv::PIV
• nlexpo : PLMD::colvar::EEFSolv
• nlinesPerStep : PLMD::generic::Read
• Nlist : PLMD::piv::PIV, PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO
• nlist : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• nlist0_ : PLMD::NeighborList
• nlist1_ : PLMD::NeighborList
• nlist_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_center_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_dev2_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_hills_ : PLMD::bias::MetaD
• nlist_index_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_pace_reset_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_param_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_steps_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nlist_update_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• nLocalAtoms : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• NLsize : PLMD::piv::PIV
• NMARTINI : PLMD::isdb::SAXS
• nmatrix_cols : PLMD::MultiValue
• Nn : PLMD::isdb::CS2Backbone
• nn : PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >
• nneigh : PLMD::clusters::DFSClustering, PLMD::gridtools::KDE
• nnf : PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >
• no_aver_ : PLMD::isdb::EMMI
• no_broadcast : PLMD::bias::MaxEnt
• no_Zed_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• noAnalyticalDerivatives() : PLMD::ActionWithValue
• noderiv : PLMD::ActionWithValue, PLMD::function::FunctionTemplateBase
• NOE() : PLMD::isdb::NOE
• noEOL : PLMD::IFile
• noforce : PLMD::ActionToPutData
• nohistory : PLMD::function::FuncSumHills
• noise_ : PLMD::isdb::EMMI
• noise_type_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• nomask : PLMD::generic::CreateMask
• noname : PLMD::Random
• NONE : PLMD::ExchangePatterns, PLMD::isdb::BAIES
• none : PLMD::FlexibleBin
• NONEBEAD : PLMD::isdb::SAXS
• nopbc : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase, PLMD::colvar::Dipole, PLMD::colvar::Gyration, PLMD::colvar::PathMSDBase, PLMD::colvar::PCARMSD, PLMD::colvar::RMSD, PLMD::generic::FitToTemplate, PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO, PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD, PLMD::vatom::Center, PLMD::vatom::Ghost
• norder_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• nores_ : PLMD::isdb::Rescale
• norm() : PLMD::metatomic::vesin::Vector
• norm_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• norm_weights : PLMD::colvar::RMSDVector
• normal : PLMD::Value
• normaliz : PLMD::symfunc::SphericalHarmonic
• normalization_ : PLMD::ves::TD_Chi, PLMD::ves::TD_ChiSquared, PLMD::ves::TD_GeneralizedExtremeValue, PLMD::ves::TD_GeneralizedNormal, PLMD::ves::TD_VonMises
• normalize : PLMD::function::Combine, PLMD::KernelFunctions, PLMD::metatomic::vesin::Vector
• normalizeCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsVector
• NormalizedEuclideanDistance() : PLMD::refdist::NormalizedEuclideanDistance
• NormalizeForceWeights() : PLMD::fisst::FISST
• normalizeGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• normalizeTargetDistGrid() : PLMD::ves::TargetDistribution
• normalmodes : PLMD::molfile::molfile_qm_hessian_t
• normVect : PLMD::isdb::CS2Backbone::RingInfo
• noStretchWarning() : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• noStretchWarningDone : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• not_in : PLMD::volumes::ActionVolume
• note : PLMD::Exception
• nothrow : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >::is_emplace_constructible_impl< Void, AI, V, Args >, PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >::is_emplace_constructible_impl< void_t< typename std::enable_if< is_complete< V >::value >::type, decltype(std::declval< AI & >().construct(std::declval< V * >(), std::declval< Args >()...))>, AI, V, Args... >
• notify : PLMD::Tools::CriticalSectionWithKey< Key >
• notperiodic : PLMD::HistogramBead, PLMD::Value
• novirial : PLMD::generic::Debug, PLMD::PlumedMain
• Np : PLMD::isdb::CS2Backbone
• npoints : PLMD::contour::FindSphericalContour, PLMD::dimred::ArrangePoints, PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• Nprec : PLMD::piv::PIV
• nProc : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• nproc : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• nranks : PLMD::colvar::Dimer
• nre : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
• nregres_ : PLMD::isdb::EMMI
• nregres_zero_ : PLMD::isdb::Caliber, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• nrep : PLMD::bias::MaxEnt
• nrep_ : PLMD::isdb::Caliber, PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase, PLMD::isdb::Rescale
• nreplicas : PLMD::generic::GatherReplicas, PLMD::wham::Wham
• nres : PLMD::isdb::SAXS
• nresidues : PLMD::ERMSD
• nrows() : PLMD::Matrix< T >
• nrows_ : PLMD::ves::CoeffsMatrix
• NS : PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP
• nsel_ : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• NSMEM : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP, PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP, PLMD::membranefusion::memFusionP
• nsplit : PLMD::MultiValue
• nstride : PLMD::LinkCells
• nt_ : PLMD::isdb::BAIES
• nt_env_set : PLMD::OpenMP::OpenMPVars
• NTAB : PLMD::Random
• NTT : PLMD::isdb::SAXS
• nuc_charge : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• nucleus : PLMD::isdb::CS2Backbone::ChemicalShift
• num_basis_atoms : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• num_basis_funcs : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• num_bytes() : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity >
• num_charge_sets : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata
• num_electrons : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• num_elements() : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity >
• num_layers : PLMD::function::annfunc::ANN
• num_neigh : PLMD::gridtools::KDE
• num_nodes : PLMD::function::annfunc::ANN
• num_occupied_A : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• num_occupied_B : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• num_orbitals_per_wavef : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata
• num_prim_per_shell : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t
• num_scfiter : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata
• num_shells : PLMD::molfile::molfile_qm_metadata_t
• num_shells_per_atom : PLMD::molfile::molfile_qm_basis_t
• num_threads : PLMD::OpenMP::OpenMPVars
• num_uninitialized() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• num_wavef : PLMD::molfile::molfile_qm_timestep_metadata
• numArgs : PLMD::lepton::PlaceholderFunction
• numAtoms : PLMD::isdb::CS2Backbone::RingInfo
• Number : PLMD::lepton::ParseToken
• number : PLMD::adjmat::Neighbors
• number2index : PLMD::PDB
• number_of_cluster : PLMD::clusters::ClusteringBase
• numbered() : PLMD::Keywords
• numberOfAtomsPerResidueInBackbone() : PLMD::MolDataClass
• numberOfBasisFunctions() : PLMD::ves::BasisFunctions
• numberOfBiases() : PLMD::ves::Optimizer
• numberOfCoeffs() : PLMD::ves::CoeffsBase, PLMD::ves::VesBias
• numberOfCoeffsSets() : PLMD::ves::Optimizer, PLMD::ves::VesBias
• numberOfDimensions() : PLMD::ves::CoeffsBase
• numberOfKernels : PLMD::gridtools::KDE
• NumberOfReplicas : PLMD::ExchangePatterns
• numbers : PLMD::funnel::FUNNEL_PS, PLMD::PDB
• numbytes : plumed_error_filesystem_path
• numdefs : PLMD::Keywords
• numerators : PLMD::function::FuncPathGeneral
• numeric_grad() : PLMD::sizeshape::position_linear_proj
• numeric_maha() : PLMD::sizeshape::position_maha_dist
• numeric_max() : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >, PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• numerical_uniform_integrals_ : PLMD::ves::BasisFunctions
• numericalDerivatives : PLMD::ActionWithValue
• numericalTargetDistributionIntegralsFromGrid() : PLMD::ves::BasisFunctions
• numericalUniformIntegrals() : PLMD::ves::BasisFunctions
• NumOMP_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• NumParallel_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::VesDeltaF
• NumWalkers_ : PLMD::opes::OPESexpanded, PLMD::opes::OPESmetad< mode >, PLMD::ves::VesDeltaF
• numXtraDists : PLMD::isdb::CS2BackboneDB
• nupdate_ : PLMD::isdb::Shadow
• nzeros : PLMD::generic::CreateMask