Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- f -

• f : PLMD::bias::MovingRestraint, PLMD::DataPassingObjectTyped< T >, PLMD::function::FunctionData< T >, PLMD::function::FunctionWithSingleArgument< T >, PLMD::molfile::md_file
• F1dim() : PLMD::F1dim< FCLASS >
• f_size : PLMD::molfile::trx_hdr, PLMD::xdrfile::t_trnheader
• fa : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• fa_max_stride_ : PLMD::bias::MetaD
• fa_min_acceleration_ : PLMD::bias::MetaD
• fa_update_frequency_ : PLMD::bias::MetaD
• fact : PLMD::Random
• factorial() : PLMD::symfunc::SphericalHarmonic
• fadefact : PLMD::mapping::PathDisplacements
• fake_der : PLMD::F1dim< FCLASS >
• FarthestPointSampling() : PLMD::landmarks::FarthestPointSampling
• fastpow() : PLMD::Tools
• fastpow_rec() : PLMD::Tools
• FastStringUnorderedMap() : PLMD::Tools::FastStringUnorderedMap< T >
• fb : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• fbox : PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift
• fc : PLMD::contour::DumpContour, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• fclose() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• fcp : PLMD::Subprocess
• fermi : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• fermi_exp_max_ : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• fermi_lambda_ : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• FermiSwitchingFunction() : PLMD::ves::FermiSwitchingFunction
• FerroNematicOrder() : PLMD::liquid_crystal::FerroNematicOrder
• fes_file_fmt_ : PLMD::ves::VesBias
• fes_filename_ : PLMD::ves::VesBias
• fes_fileoutput_active_ : PLMD::ves::VesBias
• fes_grid_pntr_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion, PLMD::ves::TargetDistribution
• fes_output_active_ : PLMD::ves::Optimizer
• fes_output_stride_ : PLMD::ves::Optimizer
• fes_var_lepton_ref_ : PLMD::ves::TD_Custom
• fes_var_str_ : PLMD::ves::TD_Custom
• fesGridNeeded() : PLMD::ves::TargetDistribution
• fesproj_fileoutput_active_ : PLMD::ves::VesBias
• fesproj_output_active_ : PLMD::ves::Optimizer
• fesproj_output_stride_ : PLMD::ves::Optimizer
• FesWeight() : PLMD::ves::FesWeight
• FF_rank : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_mixed : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_mixed_D : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_mixed_H : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_solv : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_solv_H : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_vacuum : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_vacuum_D : PLMD::isdb::SAXS
• FF_value_vacuum_H : PLMD::isdb::SAXS
• FFf_value : PLMD::isdb::SAXS
• ffict : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::logmfd::LogMFD
• fflush() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• fib_increment : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• fib_nlist : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• fib_offset : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• fib_shift : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• fibonacci : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• fict : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::logmfd::LogMFD
• fict_ave : PLMD::logmfd::LogMFD
• fict_max : PLMD::logmfd::LogMFD
• fict_min : PLMD::logmfd::LogMFD
• fictValue : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::logmfd::LogMFD
• field_iteration_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• field_ncoeffs_total_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• field_ndimensions_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• field_shape_prefix_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• field_time_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• field_type_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• fieldChanged : PLMD::OFile
• FieldExist() : PLMD::IFile
• fieldFmt : PLMD::OFile
• fields : PLMD::IFile, PLMD::OFile
• file : PLMD::Exception::Location, PLMD::generic::Committor, PLMD::generic::DumpDerivatives, PLMD::generic::DumpForces, PLMD::generic::DumpMassCharge, PLMD::generic::DumpPDB, PLMD::generic::DumpProjections, PLMD::generic::Print, PLMD::generic::PrintNDX
• FileBase() : PLMD::FileBase
• FileExist() : PLMD::FileBase
• filename : PLMD::contour::DumpContour, PLMD::generic::DumpVector, PLMD::generic::Read, PLMD::gridtools::DumpGrid
• filename_extension : PLMD::molfile::molfile_plugin_t
• filenames : PLMD::function::FilesHandler
• filenames_have_iteration_number_ : PLMD::ves::VesBias
• filenamesIncludeIterationNumber() : PLMD::ves::VesBias
• files : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• FilesHandler() : PLMD::function::FilesHandler
• fileTraj() : PLMD::fileTraj
• fillGridFromMaps() : PLMD::ves::WaveletGrid
• finalize : plumed_plumedmain_function_holder_x
• find() : PLMD::Tools::FastStringUnorderedMap< T >
• findCell() : PLMD::LinkCells
• FindContour() : PLMD::contour::FindContour
• findContour() : PLMD::contour::ContourFindingObject< T >, PLMD::contour::DistanceFromContourBase
• FindContourSurface() : PLMD::contour::FindContourSurface
• findCvsAndPeriodic() : PLMD::cltools::CLToolSumHills
• findField() : PLMD::IFile, PLMD::OFile
• FindGridOptimum() : PLMD::gridtools::FindGridOptimum
• findKeyword() : PLMD::Tools
• findMaximalPathMinimum() : PLMD::GridBase
• findMyCell() : PLMD::LinkCells
• findSetOfPointsOnContour() : PLMD::Grid
• FindSphericalContour() : PLMD::contour::FindSphericalContour
• findTempIndex() : PLMD::lepton::CompiledExpression
• first : PLMD::generic::DumpMassCharge, PLMD::generic::Plumed, PLMD::vatom::Center
• first_bias_ : PLMD::isdb::Rescale
• first_status_ : PLMD::isdb::EMMI
• first_step_ : PLMD::maze::Optimizer
• first_time_ : PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::Shadow, PLMD::maze::Optimizer
• first_time_w_ : PLMD::isdb::EMMI
• firstPosClose : PLMD::colvar::PathMSDBase
• firststep : PLMD::ActionForInterface, PLMD::ActionWithValue, PLMD::colvar::RMSDVector, PLMD::contour::FindContour, PLMD::contour::FindContourSurface, PLMD::gridtools::FunctionOfGrid< T >, PLMD::gridtools::InterpolateGrid, PLMD::gridtools::KDE< K, P, G >, PLMD::gridtools::Marginal
• firstStepFlag : PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO
• firstTime : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• firsttime : PLMD::bias::ExtendedLagrangian, PLMD::colvar::CoordinationBase, PLMD::fourier::FourierTransform, PLMD::logmfd::LogMFD, PLMD::s2cm::S2ContactModel
• firstTimeW : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• FISST() : PLMD::fisst::FISST
• FitToTemplate() : PLMD::generic::FitToTemplate
• fixArgumentDot() : PLMD::refdist::Displacement, PLMD::refdist::Kernel
• fixArgumentName() : PLMD::landmarks::CollectFrames, PLMD::landmarks::LogSumExp, PLMD::mapping::Path
• fixed : PLMD::ActionToPutData
• fixed_sigma_ : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• fixed_stepsize_ : PLMD::ves::Optimizer
• fixed_width : PLMD::gridtools::KDEHelper< K, P, G >
• FixedAtom() : PLMD::vatom::FixedAtom
• fixedStepSize() : PLMD::ves::Optimizer
• flags : PLMD::PDB, plumed_safeptr, plumed_safeptr_x
• flat : PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject
• Flatten() : PLMD::valtools::Flatten
• flexbin_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• FlexibleBin() : PLMD::FlexibleBin
• flexibleMemory() : PLMD::secondarystructure::flexibleMemory< T >
• flog : PLMD::logmfd::LogMFD
• FLOOR : PLMD::lepton::Operation
• Floor() : PLMD::lepton::Operation::Floor
• floor : PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction
• Flush() : PLMD::generic::Flush
• flush() : PLMD::FileBase, PLMD::OFile, PLMD::Subprocess
• flying_ : PLMD::bias::MetaD
• fmass : PLMD::piv::PIV
• fmin : PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• fmt : PLMD::bias::MaxEnt, PLMD::contour::DumpContour, PLMD::function::FuncSumHills, PLMD::generic::Committor, PLMD::generic::DumpDerivatives, PLMD::generic::DumpForces, PLMD::generic::DumpPDB, PLMD::generic::DumpProjections, PLMD::generic::DumpVector, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift, PLMD::generic::Print, PLMD::gridtools::DumpGrid, PLMD::molfile::md_file
• fmt_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD, PLMD::eds::EDS, PLMD::fisst::FISST, PLMD::GridBase, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• fmt_gro_box : PLMD::generic::DumpAtoms
• fmt_gro_pos : PLMD::generic::DumpAtoms
• fmt_xyz : PLMD::generic::DumpAtoms
• fmtField() : PLMD::OFile
• FMTfromString() : PLMD::TrajectoryParser
• fopen() : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• force : PLMD::ForceInput
• force_ : PLMD::maze::OptimizerBias
• force_normalization_ : PLMD::ves::TargetDistribution
• force_stash : PLMD::colvar::RMSDVector
• force_weight_ : PLMD::fisst::FISST
• forced_unique : PLMD::DomainDecomposition
• forcedNormalization() : PLMD::ves::TargetDistribution
• forceOnEnergy : PLMD::ActionAtomistic
• forceOnExtraCV : PLMD::ActionAtomistic
• forces : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::bias::Bias, PLMD::generic::EffectiveEnergyDrift, PLMD::generic::Plumed, PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• forces_ : PLMD::fisst::FISST
• forces_to_scale : PLMD::colvar::Energy
• forcesForApply : PLMD::ActionWithValue
• forcesToApply : PLMD::clusters::ClusterWeights, PLMD::contour::DistanceFromContourBase, PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• forcesWereAdded() : PLMD::Value
• foreach_pair() : PLMD::metatomic::vesin::cpu::CellList
• foreignDeltaBias : PLMD::GREX
• ForwardDecl() : PLMD::ForwardDecl< T >
• found : PLMD::TokenizedLine::presentAndFound
• fourier_params : PLMD::fourier::FourierTransform
• FourierTransform() : PLMD::fourier::FourierTransform
• fp : PLMD::FileBase, PLMD::xdrfile::XDRFILE
• fpc : PLMD::Subprocess
• fpcp : PLMD::Subprocess
• fppc : PLMD::Subprocess
• fractional : PLMD::vatom::ArgsToVatom
• fractional_to_cartesian() : PLMD::metatomic::vesin::BoundingBox
• frag2enum() : PLMD::isdb::CS2Backbone
• frame() : PLMD::AtomDistribution, PLMD::fileTraj, PLMD::repliedTrajectory, PLMD::theLine, PLMD::tiledSimpleCubic, PLMD::twoGlobs, PLMD::uniformCube, PLMD::uniformSphere
• freq_adaptive_ : PLMD::bias::MetaD
• FretEfficiency() : PLMD::isdb::FretEfficiency
• friction : PLMD::bias::ExtendedLagrangian
• from : PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >::is_memcpyable< QualifiedFrom, QualifiedTo, typename std::enable_if< is_complete< QualifiedFrom >::value >::type >, PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >::is_memcpyable_integral< From, To, typename std::enable_if< is_complete< From >::value >::type >, PLMD::gch::detail::allocator_interface< Allocator >::is_uninitialized_memcpyable_impl< QualifiedFrom, QualifiedTo >
• from_domains : PLMD::ActionToPutData
• fromSafePtr() : PLMD::TypesafePtr
• fromString() : PLMD::Random
• fromToDataHelper() : PLMD::OpenACC::fromToDataHelper< accData >
• front() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• fshift : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVectorData
• ftilde_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• full : PLMD::metatomic::vesin::VesinOptions
• fullatomlist_ : PLMD::NeighborList
• fulldata : PLMD::volumes::VolumeOutput
• fullList : PLMD::DomainDecomposition
• fullPath : PLMD::ActionOptions, PLMD::RegisterBase< Content >::ContentAndFullPath
• fullSearch() : PLMD::Pbc
• func : PLMD::F1dim< FCLASS >, PLMD::function::Custom
• funcAndDeriv() : PLMD::switchContainers::leptonSwitch::funcAndDeriv
• funcinput : PLMD::matrixtools::MatrixTimesMatrixInput< T >, PLMD::matrixtools::OuterProductInput< T >
• funcname : PLMD::GridBase
• FuncPathGeneral() : PLMD::function::FuncPathGeneral
• FuncPathMSD() : PLMD::function::FuncPathMSD
• funcstr : PLMD::symfunc::ThreeBodyGFunctionsInput
• FuncSumHills() : PLMD::function::FuncSumHills
• Function() : PLMD::function::Function, PLMD::lepton::ParseToken
• function : PLMD::contour::ContourFindingObject< T >, PLMD::function::Custom, PLMD::gridtools::EvaluateGridFunction, PLMD::gridtools::FindGridOptimum, PLMD::gridtools::MarginalInput, PLMD::lepton::Operation::Custom, PLMD::matrixtools::OutputProductFunc, PLMD::switchContainers::cosinusSwitch, PLMD::switchContainers::cubicSwitch, PLMD::switchContainers::exponentialSwitch, PLMD::switchContainers::fastgaussianSwitch, PLMD::switchContainers::fixedRational< N,, >, PLMD::switchContainers::gaussianSwitch, PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >, PLMD::switchContainers::smapSwitch, PLMD::switchContainers::SwitchInterface_lepton, PLMD::switchContainers::tanhSwitch, PLMD::SwitchingFunction
• FunctionOfGrid() : PLMD::gridtools::FunctionOfGrid< T >
• FunctionOfMatrix() : PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >
• FunctionOfScalar() : PLMD::function::FunctionOfScalar< T >
• FunctionOfVector() : PLMD::function::FunctionOfVector< T >
• functions : PLMD::symfunc::ThreeBodyGFunctionsInput, plumed_symbol_table_type_x
• FunctionShortcut() : PLMD::function::FunctionShortcut< T >
• FunctionWithSingleArgument() : PLMD::function::FunctionWithSingleArgument< T >
• funit : PLMD::ActionToPutData, PLMD::DataPassingObject
• Funnel() : PLMD::funnel::Funnel
• FUNNEL_PS() : PLMD::funnel::FUNNEL_PS
• fusionPoreExpansionP() : PLMD::membranefusion::fusionPoreExpansionP
• fusionPoreNucleationP() : PLMD::membranefusion::fusionPoreNucleationP
• Fvol : PLMD::piv::PIV