Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- m -

• m : PLMD::ActionToPutData, PLMD::RegisterBase< Content >
• m_alloc : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false >
• m_capacity : PLMD::gch::detail::small_vector_data< Pointer, SizeT, T, 0 >, PLMD::gch::detail::small_vector_data_base< Pointer, SizeT >
• m_data : PLMD::gch::detail::inline_storage< T, InlineCapacity >, PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >, PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >::stack_temporary
• m_data_ptr : PLMD::gch::detail::small_vector_data< Pointer, SizeT, T, 0 >, PLMD::gch::detail::small_vector_data_base< Pointer, SizeT >
• m_deriv : PLMD::piv::PIV
• m_interface : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >::stack_temporary
• m_PIVdistance : PLMD::piv::PIV
• m_ptr : PLMD::gch::small_vector_iterator< Pointer, DifferenceType >
• m_size : PLMD::gch::detail::small_vector_data< Pointer, SizeT, T, 0 >, PLMD::gch::detail::small_vector_data_base< Pointer, SizeT >
• m_storage : PLMD::gch::detail::small_vector_data< Pointer, SizeT, T, InlineCapacity >, PLMD::gch::detail::small_vector_data< Pointer, SizeT, T, 0 >
• m_virial : PLMD::piv::PIV
• MahalanobisDistance() : PLMD::refdist::MahalanobisDistance
• main() : PLMD::CLTool, PLMD::cltools::CLTool, PLMD::cltools::CLToolSumHills, PLMD::cltools::Completion, PLMD::cltools::Driver< real >, PLMD::cltools::GenExample, PLMD::cltools::GenJson, PLMD::cltools::GenTemplate, PLMD::cltools::Info, PLMD::cltools::kt, PLMD::cltools::Manual, PLMD::cltools::PdbRenumber, PLMD::cltools::PesMD, PLMD::cltools::ShowGraph, PLMD::cltools::SimpleMD, PLMD::cltools::SwitchingPlotter, PLMD::mapping::PathTools, PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
• make_unique() : PLMD::Tools
• makeWhole() : PLMD::ActionAtomistic
• Manual() : PLMD::cltools::Manual
• map : PLMD::Tools::FastStringUnorderedMap< T >
• map_ : PLMD::SparseGrid
• MarginalWeight() : PLMD::ves::MarginalWeight
• mass : PLMD::molfile::molfile_atom_t, PLMD::Units, PLMD::vatom::FixedAtom
• MassChargeInput() : PLMD::generic::MassChargeInput
• masses : PLMD::ActionAtomistic, PLMD::colvar::Angle, PLMD::colvar::DihedralCorrelation, PLMD::colvar::Dipole, PLMD::colvar::Distance, PLMD::colvar::Plane, PLMD::colvar::Position, PLMD::colvar::Torsion, PLMD::crystdistrib::Quaternion, PLMD::generic::Plumed
• massesWereSet : PLMD::ActionAtomistic
• massString : PLMD::Units
• master : PLMD::function::Ensemble, PLMD::isdb::Caliber, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• masv : PLMD::ActionAtomistic
• mating() : PLMD::maze::Memetic
• mating_rate_ : PLMD::maze::Memetic
• matmul : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• matpos : PLMD::Value
• Matrix() : PLMD::Matrix< T >
• matrix : PLMD::drr::UIestimator::n_matrix, PLMD::metatomic::vesin::BoundingBox
• matrix_ : PLMD::metatomic::vesin::BoundingBox
• matrix_bookeeping : PLMD::ActionWithMatrix, PLMD::MultiValue, PLMD::Value
• matrix_force_stash : PLMD::MultiValue
• matrix_row_derivative_indices : PLMD::MultiValue
• matrix_row_nderivatives : PLMD::MultiValue
• matrix_row_stash : PLMD::MultiValue
• matrix_to_do_after : PLMD::ActionWithMatrix
• matrix_to_do_before : PLMD::ActionWithMatrix
• matrixChainContinues() : PLMD::ActionWithMatrix
• MatrixOperationBase() : PLMD::matrixtools::MatrixOperationBase
• matrixOut : PLMD::Matrix< T >
• MatrixProductDiagonal() : PLMD::refdist::MatrixProductDiagonal
• MatrixSquareBracketsAccess : PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Const_row, PLMD::MatrixSquareBracketsAccess< T, C, I, J >::Row
• MatrixTimesMatrix() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesMatrix
• MatrixTimesVector() : PLMD::matrixtools::MatrixTimesVector
• MAX : PLMD::lepton::Operation
• Max() : PLMD::Communicator, PLMD::lepton::Operation::Max
• max : PLMD::contour::FindSphericalContour, PLMD::function::Moments, PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject, PLMD::HistogramBead, PLMD::Stopwatch::Watch, PLMD::Value
• max0 : PLMD::refdist::Difference
• max_ : PLMD::GridBase
• max_bias_ : PLMD::bias::MetaD
• max_coupling_grad_ : PLMD::eds::EDS
• max_coupling_range_ : PLMD::eds::EDS
• max_cs_atoms : PLMD::isdb::CS2Backbone
• max_force_ : PLMD::fisst::FISST
• max_logweight_ : PLMD::eds::EDS
• max_minus_min : PLMD::HistogramBead, PLMD::Value
• max_press_ : PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• max_size() : PLMD::gch::small_vector< T, InlineCapacity, Allocator >
• max_temp_ : PLMD::ves::TD_Multicanonical, PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• maxArgs : PLMD::lepton::ExpressionProgram
• maxbins : PLMD::adjmat::TopologyMatrix
• maxcol : PLMD::adjmat::AdjacencyMatrixBase
• maxcycles : PLMD::mapping::PathReparameterization
• maxdim : PLMD::GridBase
• MaxEnt() : PLMD::bias::MaxEnt
• maxima_ : PLMD::ves::TD_Grid, PLMD::ves::TD_Uniform
• maxiter : PLMD::dimred::ArrangePoints, PLMD::wham::Wham
• maxrank : PLMD::TypesafePtr
• MAXS : PLMD::funnel::Funnel
• maxshiftsize : PLMD::Pbc
• maxsize_ : PLMD::GridBase
• MaxSurf : PLMD::sasa::SASA_HASEL, PLMD::sasa::SASA_LCPO
• maybe_assign() : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false >, PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true >
• MCaccept_ : PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MCacceptFT_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MCacceptScale_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MCaccgamma_ : PLMD::isdb::Rescale
• MCchunksize_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MCfirst_ : PLMD::isdb::Rescale
• mcomp : PLMD::isdb::Caliber
• MCsteps_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase, PLMD::isdb::Rescale
• MCstride_ : PLMD::isdb::EMMI, PLMD::isdb::Rescale
• MCtrial_ : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MCtrials_ : PLMD::isdb::EMMI
• MD2double() : PLMD::DataPassingObject, PLMD::DataPassingObjectTyped< T >, PLMD::DataPassingTools, PLMD::DataPassingToolsTyped< T >
• MD_LinearExpansionPES() : PLMD::ves::MD_LinearExpansionPES
• MDEngine : PLMD::PlumedMain
• mdiag : PLMD::Pbc
• mdMemoryView() : PLMD::mdMemoryView< N, STRIDE >
• MDQuantityToPLUMED() : PLMD::PlumedMain
• MDUnits : PLMD::DataPassingTools
• mean() : PLMD::maze::tls
• mean_alpha_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• mean_counter_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• mean_weight_tau_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• means_ : PLMD::eds::EDS
• Member() : PLMD::maze::Member
• member_best_ : PLMD::maze::Memetic
• members_ : PLMD::maze::Memetic
• Memetic() : PLMD::maze::Memetic
• memFusionP() : PLMD::membranefusion::memFusionP
• memory : PLMD::molfile::molfile_qm_sysinfo_t
• MemoryView() : PLMD::MemoryView< N >
• mergeKernels() : PLMD::opes::OPESmetad< mode >
• message : PLMD::lepton::Exception
• MET : PLMD::isdb::CS2Backbone, PLMD::isdb::SAXS
• MET_BB : PLMD::isdb::SAXS
• MET_SC1 : PLMD::isdb::SAXS
• meta : PLMD::logmfd::LogMFD
• MetaD() : PLMD::bias::MetaD
• metader_ : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• Metainference() : PLMD::isdb::Metainference
• MetainferenceBase() : PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MetatomicPlumedAction() : PLMD::metatomic::MetatomicPlumedAction
• methyl : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• metric : PLMD::mapping::PathProjectionCalculator
• mfict : PLMD::logmfd::LogMFD
• MFilterLess() : PLMD::multicolvar::MFilterLess
• MFilterMore() : PLMD::multicolvar::MFilterMore
• MGAUSS : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• midpoints : PLMD::gridtools::InterpolateGrid
• MIN : PLMD::lepton::Operation
• Min() : PLMD::Communicator, PLMD::lepton::Operation::Min
• min : PLMD::bias::ABMD, PLMD::contour::FindSphericalContour, PLMD::function::Highest, PLMD::function::Moments, PLMD::gridtools::GridCoordinatesObject, PLMD::HistogramBead, PLMD::Stopwatch::Watch, PLMD::Value
• min0 : PLMD::refdist::Difference
• min_ : PLMD::GridBase
• min_force_ : PLMD::fisst::FISST
• min_press_ : PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• min_temp_ : PLMD::ves::TD_Multicanonical, PLMD::ves::TD_MultithermalMultibaric
• minima_ : PLMD::ves::TD_Chi, PLMD::ves::TD_ChiSquared, PLMD::ves::TD_Exponential, PLMD::ves::TD_Grid, PLMD::ves::TD_Uniform
• minimise() : PLMD::ConjugateGradient< FCLASS >, PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• Minimise1DBrent() : PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• MinimiseBase() : PLMD::MinimiseBase< FCLASS >
• minimised : PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >
• minimization_step_ : PLMD::ves::VesDeltaF
• MINS : PLMD::funnel::Funnel
• minTOzero : PLMD::function::FuncSumHills
• mintype : PLMD::dimred::ArrangePoints
• missingKey : PLMD::ExceptionRegisterError
• mm : PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >
• mmf : PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >
• mobile_str : PLMD::sizeshape::position_linear_proj, PLMD::sizeshape::position_maha_dist
• mode : PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T >, PLMD::FileBase, PLMD::xdrfile::XDRFILE
• ModelType : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• modeltype_ : PLMD::s2cm::S2ContactModel
• modifyForceOnEnergy() : PLMD::ActionAtomistic
• modulo() : PLMD::VectorGeneric< n >
• modulo2() : PLMD::VectorGeneric< n >
• moldat_ : PLMD::Tree
• molfile_lock() : PLMD::Tools
• moment : PLMD::function::Ensemble
• monitor_instantaneous_gradient_ : PLMD::ves::Optimizer
• moreThanOne : PLMD::switchContainers::rational< isFast, nis2m >
• MOUTLIERS : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• move_allocation_pointer() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign_default() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_assign_is_noop : PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, false >, PLMD::gch::detail::allocator_inliner< Allocator, true >
• move_assign_unequal_no_propagate() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_initialize() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_left() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• move_right() : PLMD::gch::detail::small_vector_base< Allocator, InlineCapacity >
• moveScaleOffset() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• moveSigmas() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• moveTilde() : PLMD::isdb::Metainference, PLMD::isdb::MetainferenceBase
• MovingRestraint() : PLMD::bias::MovingRestraint
• mpi_id_ : PLMD::bias::PBMetaD
• mpi_nw_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• mpi_request_index : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• mpi_request_positions : PLMD::DomainDecomposition::DomainComms
• mpiSumValuesAndDerivatives() : PLMD::Grid
• msdv : PLMD::colvar::PathMSDBase
• msg : PLMD::Exception
• mt_eng() : PLMD::maze::rnd
• mtype : PLMD::PDB
• mtype_ : PLMD::isdb::BAIES
• mu_s : PLMD::isdb::RDC
• mult : PLMD::isdb::Caliber, PLMD::Matrix< T >
• multi : PLMD::cltools::GenExample, PLMD::KernelFunctions
• multi_prop_ : PLMD::eds::EDS
• multi_sim_comm : PLMD::Action, PLMD::PlumedMain
• multi_sim_comm_fwd : PLMD::PlumedMain
• multicoeffs_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• multicoeffs_args_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• multicoeffs_basisf_ : PLMD::ves::CoeffsBase
• MultiCoeffs_LinearBasisSet : PLMD::ves::CoeffsBase
• MultiColvarDensity() : PLMD::gridtools::MultiColvarDensity
• MultiColvarTemplate() : PLMD::colvar::MultiColvarTemplate< T >
• multiLinearInterpolation() : PLMD::ves::GridLinearInterpolation
• multiplicity : PLMD::molfile::molfile_qm_wavefunction_t
• MULTIPLY : PLMD::lepton::Operation
• Multiply() : PLMD::lepton::Operation::Multiply
• MULTIPLY_CONSTANT : PLMD::lepton::Operation
• MultiplyConstant() : PLMD::lepton::Operation::MultiplyConstant
• multiplyWithValues() : PLMD::ves::CoeffsVector
• MultiRMSD() : PLMD::colvar::MultiRMSD
• multiSimSumAverages() : PLMD::ves::VesBias
• MultiValue() : PLMD::MultiValue
• multivariate : PLMD::bias::MetaD::Gaussian, PLMD::bias::PBMetaD::Gaussian
• mus_ : PLMD::isdb::BAIES
• mutation() : PLMD::maze::Memetic
• mutation_rate_ : PLMD::maze::Memetic
• mutex : PLMD::Register, PLMD::Tools::CriticalSectionWithKey< Key >
• mw_dir_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• mw_id_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• mw_n_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• mw_rstride_ : PLMD::bias::MetaD, PLMD::bias::PBMetaD
• mwalkers_mpi_single_files_ : PLMD::ves::Optimizer
• my_repl : PLMD::function::Ensemble
• myclass_func : PLMD::Brent1DRootSearch< FCLASS >, PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >, PLMD::Minimise1DBrent< FCLASS >, PLMD::MinimiseBase< FCLASS >, PLMD::RootFindingBase< FCLASS >
• mycomm : PLMD::BiasRepresentation, PLMD::ves::CoeffsMatrix, PLMD::ves::CoeffsVector
• mycomm_ : PLMD::ves::LinearBasisSetExpansion
• mydata : PLMD::ActionToGetData, PLMD::ActionToPutData
• myenergy : PLMD::bias::ReweightTemperaturePressure
• myfgrid : PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >
• myfunc : PLMD::function::FunctionOfMatrix< T >, PLMD::function::FunctionOfScalar< T >, PLMD::function::FunctionOfVector< T >, PLMD::function::FunctionShortcut< T >, PLMD::gridtools::FunctionOfGrid< T >
• mygrid : PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >
• myinterp : PLMD::gridtools::GridSearch< FCLASS >
• myiter : PLMD::function::FuncPathMSD
• mylinks : PLMD::volumes::VolumeInEnvelope
• mylog : PLMD::Stopwatch
• mymatrix : PLMD::matrixtools::DiagonalizeMatrix, PLMD::matrixtools::InvertMatrix
• mymin : PLMD::contour::ContourFindingBase, PLMD::contour::DistanceFromContourBase
• myminimiser : PLMD::dimred::ProjectPoints
• mypath_obj : PLMD::mapping::PathProjectionCalculator
• mypbc : PLMD::LinkCells
• mypos : PLMD::dimred::ArrangePoints
• myrank : PLMD::colvar::Dimer
• myrep : PLMD::bias::MaxEnt
• myreplica : PLMD::GREX
• myrmsd : PLMD::colvar::RMSD, PLMD::colvar::RMSDVector, PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• mytype : PLMD::GenericMolInfo, PLMD::switchContainers::baseSwitch
• myvol : PLMD::bias::ReweightTemperaturePressure