- d -

• deactivate() : PLMD::Action , PLMD::DynamicList< T >
• deactivate_task() : PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase , PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• deactivateAll() : PLMD::DynamicList< T >
• Debug() : PLMD::generic::Debug
• Density() : PLMD::multicolvar::Density
• description() : PLMD::CLTool , PLMD::cltools::CLToolSumHills , PLMD::cltools::Driver< real > , PLMD::cltools::GenTemplate , PLMD::cltools::Info , PLMD::cltools::Manual , PLMD::cltools::SimpleMD , PLMD::HistogramBead , PLMD::multicolvar::Moments , PLMD::multicolvar::StoreCentralAtomsVessel , PLMD::SwitchingFunction , PLMD::vesselbase::BridgeVessel , PLMD::vesselbase::FunctionVessel , PLMD::vesselbase::ShortcutVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• destroyData() : PLMD::Keywords
• determinant() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• DHEnergy() : PLMD::colvar::DHEnergy , PLMD::multicolvar::DHEnergy
• difference() : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::HistogramBead , PLMD::Value
• Dipole() : PLMD::colvar::Dipole
• Distance() : PLMD::colvar::Distance
• distance() : PLMD::Pbc
• Distances() : PLMD::multicolvar::Distances
• DLLoader() : PLMD::DLLoader
• doCalculation() : PLMD::multicolvar::MultiColvar , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• doJobsRequiredBeforeTaskList() : PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• DomainDecomposition() : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• double2MD() : PLMD::Atoms , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• Driver() : PLMD::cltools::Driver< real >
• DRMSD() : PLMD::colvar::DRMSD , PLMD::DRMSD
• DumpAtoms() : PLMD::generic::DumpAtoms
• DumpDerivatives() : PLMD::generic::DumpDerivatives
• DumpForces() : PLMD::generic::DumpForces
• DumpProjections() : PLMD::generic::DumpProjections
• DynamicList() : PLMD::DynamicList< T >