Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- g -

• g2l : PLMD::Atoms::DomainDecomposition
• ga_lista : PLMD::colvar::Dipole
• gatindex : PLMD::Atoms
• Gaussian() : PLMD::bias::MetaD::Gaussian
• gaussian : PLMD::HistogramBead , PLMD::KernelFunctions
• Gaussian() : PLMD::Random
• gaussian : PLMD::SwitchingFunction
• gbin : PLMD::analysis::Histogram
• gcmd() : PLMD::Plumed
• gcreate() : PLMD::Plumed
• generateBins() : PLMD::HistogramBead
• generic : PLMD::Pbc
• GenTemplate() : PLMD::cltools::GenTemplate
• geometry : PLMD::FlexibleBin
• get() : PLMD::Keywords , PLMD::Stopwatch::Time , PLMD::Value
• Get_comm() : PLMD::Communicator
• Get_count() : PLMD::Communicator::Status
• get_d0() : PLMD::SwitchingFunction
• get_fdf() : PLMD::CInterpolation , PLMD::InterpolateBicubic , PLMD::InterpolateCubic
• get_r0() : PLMD::SwitchingFunction
• Get_rank() : PLMD::Communicator
• Get_size() : PLMD::Communicator
• Get_world() : PLMD::Communicator
• getAbsoluteIndex() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::multicolvar::MultiColvar
• getAbsoluteIndexes() : PLMD::ActionAtomistic
• getAction() : PLMD::vesselbase::Vessel
• getActionSet() : PLMD::PlumedMain
• getAllInput() : PLMD::vesselbase::Vessel
• getArgNames() : PLMD::Grid
• getArgument() : PLMD::ActionWithArguments
• getArguments() : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::analysis::Analysis
• getAtomIndex() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• getAtomName() : PLMD::PDB , PLMD::SetupMolInfo
• getAtomNumbers() : PLMD::PDB
• getAtomRange() : PLMD::PDB
• getAtoms() : PLMD::PlumedMain
• getBackbone() : PLMD::PDB , PLMD::SetupMolInfo
• getBeta() : PLMD::PDB
• getBias() : PLMD::PlumedMain
• getBiasAndDerivatives() : PLMD::bias::MetaD
• getbigb() : PLMD::HistogramBead
• getBinVolume() : PLMD::Grid
• getBox() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T > , PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::Pbc
• getBoxDerivatives() : PLMD::Colvar
• getBufferElement() : PLMD::vesselbase::Vessel
• getCenter() : PLMD::KernelFunctions
• getCentralAtom() : PLMD::multicolvar::AlphaBeta , PLMD::multicolvar::Angles , PLMD::multicolvar::Bridge , PLMD::multicolvar::CoordinationNumbers , PLMD::multicolvar::Density , PLMD::multicolvar::Distances , PLMD::multicolvar::MultiColvar , PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• getCentralAtomDerivative() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• getCentralAtoms() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• getChainID() : PLMD::PDB
• getChainNames() : PLMD::PDB
• getCharge() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::multicolvar::MultiColvar
• getCharges() : PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• getClosePair() : PLMD::NeighborList
• getCol() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• getComponent() : PLMD::ActionWithValue
• getComponentsList() : PLMD::ActionWithValue
• getComponentsVector() : PLMD::ActionWithValue
• getContinuousSupport() : PLMD::KernelFunctions
• getCrossTermDenominator() : PLMD::CInterpolation
• getCutoff() : PLMD::KernelFunctions
• getDataPoint() : PLMD::analysis::Analysis
• getDefaultValue() : PLMD::Keywords
• getDependencies() : PLMD::Action
• getDerivative() : PLMD::Value
• getDimension() : PLMD::Grid
• getDocumentation() : PLMD::Action
• getDomain() : PLMD::Value
• getDx() : PLMD::Grid
• getElementDerivative() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getElementValue() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getEnergy() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::Atoms , PLMD::Units
• getEnergyString() : PLMD::Units
• getExchangePatterns() : PLMD::PlumedMain
• getExchangeStep() : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• getFile() : PLMD::generic::Read
• getFilename() : PLMD::generic::Read
• getFinalValue() : PLMD::vesselbase::FunctionVessel
• getFlag() : PLMD::ExchangePatterns
• getForce() : PLMD::Colvar , PLMD::Value
• getForcesFromVessels() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getFullAtomList() : PLMD::NeighborList
• getFullList() : PLMD::Atoms
• getGaussianSupport() : PLMD::bias::MetaD
• getGradients() : PLMD::ActionWithVirtualAtom
• getGridBoundaries() : PLMD::CInterpolation
• getGridPtr() : PLMD::BiasRepresentation
• getHeight() : PLMD::bias::MetaD
• getIndex() : PLMD::ActionWithVirtualAtom , PLMD::Grid
• getIndexPair() : PLMD::NeighborList
• getIndices() : PLMD::Grid
• getInputData() : PLMD::CLTool
• getInvBox() : PLMD::Pbc
• getInverseMatrix() : PLMD::FlexibleBin
• getIsPeriodic() : PLMD::Grid
• getKBoltzmann() : PLMD::Atoms
• getKey() : PLMD::Tools
• getKeyword() : PLMD::Keywords
• getKeywords() : PLMD::vesselbase::VesselRegister
• getLabel() : PLMD::Action , PLMD::vesselbase::Vessel
• getLabelList() : PLMD::ActionSet
• getLabelVector() : PLMD::ActionSet
• getLastUpdate() : PLMD::NeighborList
• getLength() : PLMD::Units
• getLengthString() : PLMD::Units
• getline() : PLMD::IFile , PLMD::Tools
• getList() : PLMD::ExchangePatterns
• getLog() : PLMD::PlumedMain
• getLogicalDefault() : PLMD::Keywords
• getlowb() : PLMD::HistogramBead
• getMass() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::multicolvar::MultiColvar
• getMasses() : PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• getMatrix() : PLMD::FlexibleBin , PLMD::KernelFunctions
• getMax() : PLMD::Grid
• getMaxSize() : PLMD::SparseGrid
• getMaxValue() : PLMD::Grid
• getMDKBoltzmann() : PLMD::Atoms
• getMDUnits() : PLMD::Atoms
• getMethod() : PLMD::RMSD
• getMin() : PLMD::Grid
• getMinMaxBin() : PLMD::BiasRepresentation , PLMD::function::FilesHandler
• getMinValue() : PLMD::Grid
• getName() : PLMD::Action , PLMD::BiasRepresentation , PLMD::Value , PLMD::vesselbase::Vessel
• getNames() : PLMD::BiasRepresentation
• getNatoms() : PLMD::Atoms
• getNAtoms() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• getNbin() : PLMD::Grid
• getNeighbors() : PLMD::Grid , PLMD::NeighborList
• getNLTolerance() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• getNormalization() : PLMD::analysis::Analysis
• getNumberActive() : PLMD::DynamicList< T >
• getNumberOfArguments() : PLMD::ActionWithArguments , PLMD::analysis::Analysis
• getNumberOfAtoms() : PLMD::ActionAtomistic
• getNumberOfBaseFunctions() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• getNumberOfColvars() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase
• getNumberOfComponents() : PLMD::ActionWithValue
• getNumberOfDataPoints() : PLMD::analysis::Analysis
• getNumberOfDerivatives() : PLMD::ActionWithValue , PLMD::manyrestraints::ManyRestraintsBase , PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD , PLMD::Value , PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getNumberOfDimensions() : PLMD::BiasRepresentation
• getNumberOfFunctionsInAction() : PLMD::secondarystructure::SecondaryStructureRMSD
• getNumberOfKernels() : PLMD::BiasRepresentation
• getNumberOfSplinePoints() : PLMD::CInterpolation
• getNumberOfStoredColvars() : PLMD::multicolvar::StoreColvarVessel
• getNumberOfTerms() : PLMD::multicolvar::StoreCentralAtomsVessel , PLMD::multicolvar::StoreColvarVessel , PLMD::vesselbase::BridgeVessel , PLMD::vesselbase::FunctionVessel , PLMD::vesselbase::ShortcutVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• getNumberOfVessels() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getNumbersOfPoints() : PLMD::CInterpolation
• getNumericalLabel() : PLMD::vesselbase::Vessel
• getOccupancy() : PLMD::PDB
• getOutputFormat() : PLMD::analysis::Analysis
• getOutputQuantity() : PLMD::ActionWithValue
• getParsedLine() : PLMD::Tools
• getPbc() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::multicolvar::ActionVolume
• getPeriodicityInformation() : PLMD::analysis::Analysis
• getPntrToAction() : PLMD::Value
• getPntrToArgument() : PLMD::ActionWithArguments
• getPntrToComponent() : PLMD::ActionWithValue
• getPntrToMultiColvar() : PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• getPntrToValue() : PLMD::ActionWithValue
• getPntrToVessel() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getPoint() : PLMD::Grid
• getPointSpacing() : PLMD::CInterpolation
• getPosition() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::multicolvar::ActionVolume , PLMD::multicolvar::MultiColvar , PLMD::multicolvar::StoreCentralAtomsVessel
• getPositionOfCentralAtom() : PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• getPositions() : PLMD::ActionAtomistic , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T > , PLMD::PDB
• getProjection() : PLMD::ActionWithArguments
• getPtrToValue() : PLMD::BiasRepresentation
• getPtrToValues() : PLMD::BiasRepresentation
• getRealPrecision() : PLMD::Atoms , PLMD::MDAtomsBase , PLMD::MDAtomsTyped< T >
• getReducedAtomList() : PLMD::NeighborList
• getRemark() : PLMD::PDB
• getResidueName() : PLMD::PDB , PLMD::SetupMolInfo
• getResidueNumber() : PLMD::PDB , PLMD::SetupMolInfo
• getResidueRange() : PLMD::PDB
• getRestart() : PLMD::PlumedMain
• getRow() : PLMD::TensorGeneric< n, m >
• getSeparation() : PLMD::multicolvar::MultiColvarBase , PLMD::multicolvar::MultiColvarFunction
• getSigma() : PLMD::multicolvar::ActionVolume
• getSize() : PLMD::Grid , PLMD::SparseGrid
• getSplineNeighbors() : PLMD::Grid
• getSplinePoint() : PLMD::CInterpolation
• getStep() : PLMD::Action , PLMD::PlumedMain
• getStride() : PLMD::ActionPilot , PLMD::NeighborList
• getSuffix() : PLMD::PlumedMain
• getSupport() : PLMD::KernelFunctions
• getTime() : PLMD::Action , PLMD::Units
• getTimeStep() : PLMD::Action , PLMD::Atoms
• getTimeString() : PLMD::Units
• getTolerance() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel , PLMD::vesselbase::Vessel
• getUnique() : PLMD::ActionAtomistic
• getUnits() : PLMD::Atoms
• getValue() : PLMD::Grid , PLMD::multicolvar::StoreColvarVessel , PLMD::SparseGrid
• getValueAndDerivatives() : PLMD::Grid , PLMD::SparseGrid
• getVessel() : PLMD::vesselbase::ActionWithVessel
• getVirtualAtomsAction() : PLMD::Atoms
• getWeight() : PLMD::multicolvar::StoreColvarVessel
• getWords() : PLMD::Tools
• gfinalize() : PLMD::Plumed
• Ghost() : PLMD::vatom::Ghost
• ginitialized() : PLMD::Plumed
• global() : PLMD::Plumed
• gmax : PLMD::analysis::Histogram
• gmin : PLMD::analysis::Histogram
• gradients : PLMD::ActionWithVirtualAtom , PLMD::Value
• GREX() : PLMD::GREX
• grex : PLMD::PlumedMain
• Grid() : PLMD::Grid
• grid_ : PLMD::bias::MetaD , PLMD::Grid
• gridfile_ : PLMD::bias::MetaD
• gridfilename_ : PLMD::bias::MetaD
• gridfname : PLMD::analysis::Histogram
• gridreadfilename_ : PLMD::bias::MetaD
• Group() : PLMD::generic::Group
• groups : PLMD::Atoms , PLMD::generic::WholeMolecules
• GTPC_1 : PLMD::colvar::Gyration
• GTPC_2 : PLMD::colvar::Gyration
• GTPC_3 : PLMD::colvar::Gyration
• Gyration() : PLMD::colvar::Gyration
• GYRATION_1 : PLMD::colvar::Gyration
• GYRATION_2 : PLMD::colvar::Gyration
• GYRATION_3 : PLMD::colvar::Gyration